Introduction to bioinformatics
1. |
Subject title |
Introduction to bioinformatics Вовед во биоинформатиката |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2. |
Code |
F23L3W085 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3. |
Study program |
Примена на информациски технологии, Софтверско инженерство и информациски системи, Компјутерски науки, Компјутерско инженерство, Интернет, мрежи и безбедност, Информатичка едукација, Software engineering and information systems, Примена на информациски технологии, Софтверско инженерство и информациски системи, Компјутерски науки, Компјутерско инженерство, Интернет, мрежи и безбедност, Software engineering and information systems, Стручни студии за програмирање, Стручни студии за програмирање, Bioinformatics, |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4. |
Organizer of the study program (unit, institute, department, division) |
Faculty of Information Sciences and Computer Engineering |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5. |
Study cycle (first, second, third) |
Прв циклус |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6. |
Academic year / semester 4 / Зимски |
7. Number of ECTS credits 6.0 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8. |
Instructor |
ворн. проф. д-р Моника Симјаноска Мишева проф. д-р Невена Ацковска |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9. |
Prerequisites for enrollment |
Вештачка интелигенција или Машинско учење или Вовед во науката за податоци |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10. |
Subject goals and competencies: Students to become familiar with the areas and problems covered by bioinformatics, to be able to perform gene and protein sequence analysis, to use biological databases, to learn computational methods for solving problems in molecular biology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11. |
Subject content: What is Bioinformatics? A central paradigm in bioinformatics. DNA sequence analysis. RNA and protein secondary structure prediction. Tertiary protein structures and their relation to protein function. An introduction to computational tools and algorithms for solving problems in molecular biology. Concepts of gene expression and microarray technology. Concept of systems biology. Management structures in bioinformatics. DNA programming. Using genomic and protein databases. Introduction to Genetic Engineering. |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12. |
Learning methods: предавања, проекти, дискусии, работилници |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13. |
Total available time fund |
6.0 ECTS x 30 hours = 180 hours |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14. |
Time distribution |
30 + 45 + 15 + 15 + 75 = 180 hours
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15. |
Forms of teaching activities |
15.1. |
Lectures - theoretical teaching |
30 hours |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15.2. |
Exercises (laboratory, classroom), seminars, team work |
45 hours |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16. |
Other forms of activities |
16.1. |
Project tasks |
15 hours
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16.2. |
Independent tasks |
15 hours |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16.3. |
Homework |
75 hours |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17. |
Grading method |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17.1. |
Tests |
0 points |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17.2. |
Seminar work / project (presentation: written and oral) |
15 points |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17.3. |
Activities and learning |
10 points |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17.4. |
Final exam |
60 points |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18. |
Grading criteria (points / grade) |
up to 50 points |
5 (five) (F) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
from 51 to 60 points |
6 (six) (E) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
from 61 to 70 points |
7 (seven) (D) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
from 71 to 80 points |
8 (eight) (C) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
from 81 to 90 points |
9 (nine) (B) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
from 91 to 100 points |
10 (ten) (A) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19. |
Condition for signature and taking final exam |
Реализирани активности 15, 16 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
20. |
Language of instruction |
Македонски и англиски |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
21. |
Quality assurance method |
/
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22. |
Literature |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22.1. |
Mandatory literature |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
22.2. |
Additional literature |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||